美开发出寻找肿瘤基因变异的新方法

发布时间: 2012-05-06 阅读点击:91

 

    据物理学家组织网报道,近日于美国芝加哥召开的美国癌症研究学会年度会议上,华盛顿大学圣路易斯医学院研究人员报告说,他们通过一种强大的数字测序技术,对700多位病人的肿瘤细胞的基因组进行了完整测序,不仅从根源找出病人肿瘤中的变异,而且绘制了基因演化过程图,并能监视治疗反应。该研究有助于指导未来的癌症临床实验设计,以这些测序结果为基础,为每个病人制定最佳的治疗方案。

    

    新疗法可直接瞄准癌症基因的驱动变异

 

    迄今为止,研究人员对所有病人肿瘤样本的基因组进行了完整测序,把肿瘤细胞的基因序列和该病人正常细胞的基因序列进行了对比,以验证病人的癌症基因变异。医学院基因组研究所副主任伊莲妮·马蒂斯说:“在治疗中,基因组分析能在许多时间点上发挥重要作用,找出肿瘤基因组中的‘驱动’变异,并确定以前携带有这些变异的细胞经过治疗有没有被清除。”

 

    他们按基因构成而不是所在身体部位对肿瘤进行了重新分类。如在乳腺癌基因中,他们发现了大量“驱动”变异,以前认为这些变异只和乳腺肿瘤有关,但现在发现,在前列腺癌、结肠直肠癌、肺癌、皮肤癌、白血病以及其他癌症中也有这些变异基因。瞄准这些变异的药物不仅能用于乳腺癌,还可用于其他癌症。

 

    此外,整个癌症变异发展过程也对治疗决策非常重要。研究人员利用“深度数字测序”技术,对样本的每个变异都进行了1000多次测序,获得了每个变异的频率,绘制了癌细胞基因随病情发展的演化过程。他们发现,随着癌症发展,肿瘤需要新的变异,但仍要保持原来在最初位置导致癌变的那部分变异群。马蒂斯说,这表明如果直接瞄准癌症早期的基因变异,标靶药物的效果会更好。如果瞄准那些后期才出现的癌细胞的专有变异,可能就没什么效果,它们不能杀死所有的肿瘤细胞。

 

    马蒂斯还指出,要拼起一幅精确的癌细胞演化图,必须进行完整的基因组测序。如果只对部分基因测序就缺乏统计上的分量。

 

    肿瘤病人将迎来个性化治疗方案

 

    通过基因测序,医生能预先知道某种药物会对哪些人管用。比如一种芳香化酶抑制剂能在手术前缩小乳腺肿瘤,但只对约50%的妇女管用。在对患雌激素受体阳性乳腺癌的绝经妇女进行的Ⅲ期临床治疗中,研究人员在用药前后对病人乳腺肿瘤基因进行了测序,验证了预测。“哪个人会对治疗产生反应非常明显。”马蒂斯说,“以前没人能在这种水平看到治疗反应。”

 

    他们还在乳腺肿瘤中发现了一系列变异,都能对一些小分子抑制剂起反应,这表明用芳香化酶抑制剂无效的病人,可以采用常规化学疗法和试验中指示的小分子抑制剂相结合的方案。

 

“个性化医疗需要根据每个病人的肿瘤变异来选择药物,而在通常的临床试验中,只是随机性地给病人设计一种治疗方案。测序能为病人确定最佳治疗方案提供关键信息。”马蒂斯说,但肿瘤学家还需要一种规范化的变化,才能评价个体化癌症治疗的潜在利益。

 

                                                         来源:科技日报

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